РНК-полимераза II, ключевой фермент генной экспрессии, отвечает за транскрипцию или расшифровку ДНК в РНК посыльном. Что бывает в случае ошибки транскрипции? Это может привести к пагубному эффекту на повторный перевод ошибочного РНК посыльного в белок.
Некорректность транскрипции может вызвать старение и болезни, такие как рак. Во время транскрипции РНК-полимераза II может выявить некорректную РНК и откатить процесс, чтобы исправить ошибки и гарантировать, что каждый созданный посыльный РНК будет соответствовать шаблону ДНК. Однако остается тайной, как именно РНК-полимераза II управляет точностью генной транскрипции.
Ученые из Гонконгского университета науки и техники объяснили динамику отката на атомном уровне, построив кинетическую модель (Модель скрытых состояний Маркова), основанную на обширных симуляциях молекулярной динамики.
Выяснилось, что откат РНК-полимеразы II происходит пошагово: сначала РНК двигается от активного участка, а затем фермент достигает состояния отката.
Результаты опубликованы в издании Nature Communications.
— Мы выяснили, что критическая аминокислота Rpb1 Threonine 831 служит в качестве зонда для обнаружения слабого взаимодействия между РНК и шаблонной ДНК, отметил в заключение доцент Цзю Юи Юань.
