Обнародован новый метод идентификации участков РНК-редактирования и мутаций

Ученые открыли совершенно новый метод идентификации генетических маркеров многих болезней, совершив важный шаг на пути к новой эпохе персонализированной медицины, настроенной на ДНК и РНК каждого пациента.

Метод, получивший название GIREMI, поможет ученым недорого идентифицировать участки изменения РНК, генетические мутации и отдельные нуклеотидные полиморфизмы — крошечные вариации в генетической последовательности — и может использоваться для диагностики и профилактики риска широкого диапазона болезней, от раков до шизофрении, заявила старший автор Цинь Шу Цзяо, доцент интегральной биологии и физиологии колледжа Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе.

Подробности опубликованы в издании Nature Methods.

Цзяо на своем сайте выложила в открытый доступ для бесплатного скачивания свою программу, чтобы ученые всего мира могли использовать этот точный метод в собственных исследованиях заболеваний. Подход, который называют персонифицированной медициной или точной медициной, обладает потенциалом «поставки правильного лечения в нужное время нужному пациенту», как отметил президент США Барак Обама.

Гены содержат участки изменения РНК, которые пока еще плохо изучены, но при этом, кажется, содержат ключевую информацию ко многим заболеваниям. Можно подумать, что то, что выражено в наших белках, не зависит от того, какую ДНК мы унаследовали. Однако получается, что существует процесс модификации РНК под названием РНК-редактирование, который может способствовать разным типам рака, аутизму, болезни Альцгеймера, болезни Паркинсона и многим другим, сообщила Цзяо.

РНК-редактирование изменяет нуклеотиды, образцы которых несут данные, требуемые для построения белков. Например, если у вас в ДНК есть A-нуклеотид, его можно преобразовать в G-нуклеотид.

РНК-редактирование отличается от мутации. Мутация неправильно записывается в наших генах. При РНК-редактировании наш генетический материал вполне обычен, а изменения происходят позже, когда выражен ген.

Метод GIREMI исследовался и разрабатывался два года Цзяо и постдоком Цзинь Чжан из ее лаборатории. Это наиболее точный и чувствительный метод идентификации участков РНК-редактирования, а также мутаций в РНК.