Биологи во главе с известным генетиком Джорджем Черчем создали способ секвенирования РНК in situ, то есть в естественных условиях, что позволяет составить карту экспрессии тысяч генов в рамках от субклеточного уровня до целого мозга либо эмбриона.
Метод получил наименование FISSEQ. Секвенирование FISSEQ дает возможность определить последовательности молекул РНК, что находятся в различных частях клетки. Секвенирование проходит с напоминающим оптическую микроскопию разрешением.
Сначала образец необходимо зафиксировать, потом разрезать на тонкие слои. В клетках уничтожают мембраны. РНК при помощи обратной транскриптазы переводят в требуемую ДНК-копию, которую потом многократно амплифицируют.
До создания FISSEQ биологи могли или установить пространственное распределение ряда РНК (метод мечения in situ FISH), или определить последовательность всех РНК, однако потерять при этом пространственную информацию (секвенирование). Разработанный метод сочетает две эти возможности, что, по все видимости, приведет к появлению нового типа исследований в эмбриологии и анализах мозга.
