Своевременное лечение ЛОР-заболеваний – залог здоровья всего организма
Своевременное лечение ЛОР-заболеваний – залог здоровья всего организма

Плохая экология, вредные привычки, неправильный образ жизни – основные причины роста числа заболеваний ЛОР-органов.

Медикаментозного лечения катаракты не существует
Медикаментозного лечения катаракты не существует

Катаракта – помутнение хрусталика. Он перестает пропускать световые лучи, зрение ухудшается, по мере развития болезни – может пропасть совсем.

Интимное отбеливание: что это такое
Интимное отбеливание: что это такое

Чтобы чувствовать себя уверенно и на все сто, недостаточно привести в порядок кожу лица, хотя и это немаловажно. Также должное внимание необходимо уделять и другим участкам, которые обычно скрыты от посторонних глаз.

Биоинформатики нашли в человеческих фекалиях 79 кандидатов на новые антибиотики

Биоинформатики нашли в человеческих фекалиях 79 кандидатов на новые антибиотики

Международная группа ученых под руководством Павла Певзнера, руководителя лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, создала новый вычислительный метод для поиска циклопептидов — класса веществ, в который входят многие известные антибиотики.

С помощью подхода, названного CycloNovo, ученые проанализировали масс-спектры образцов человеческого кала и нашли там 79 возможных кандидатов на роль убийцы бактерий.

Результаты исследования опубликованы в престижном научном журнале Cell Systems.

Когда мы говорим об антибиотиках, то в первую очередь думаем о лекарственных препаратах, которые можно купить в аптеке. Однако антибиотики — это прежде всего микроскопические пули, которыми бактерии убивают друг друга. Люди попросту взяли и адаптировали часть из этих биологически активных веществ для своих нужд — борьбы с инфекциями. Так как возможностью производить подобные вещества обладают разнообразные микроорганизмы, возникает вопрос: а могут ли и бактерии, обитающие в нашем кишечнике (которых насчитывают до тысячи различных видов) производить антибиотики?

В поисках ответа на этот вопрос международная группа ученых под руководством Павла Певзнера, руководителя лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, профессора Калифорнийского университета в Сан-Диего (UCSD) и одного из ведущих специалистов в области биоинформатики, создала новый вычислительный метод для поиска циклопептидов — фармакологически важного класса веществ, включающего в себя много известных антибиотиков, противоопухолевых соединений и иммунодепрессантов.

Циклическая структура подобных молекул, с одной стороны, придает им важные физико-химические свойства, позволяющие использовать их в качестве лекарственных препаратов, а с другой — значительно усложняет их обнаружение в исследуемых учеными природных образцах.

Начиная с грамицидина С, открытого советскими учеными Георгием Гаузе и Марией Бражниковой в 1942 году, до настоящего времени было найдено и описано всего порядка 1200 циклопептидов. Трудности обнаружения подобных веществ и определения их строения приводят к тому, что работа по открытию каждого нового соединения растягивается на долгие годы. Прорывы последних лет в области биотехнологии и биоинформатики приблизили нас к появлению гораздо более быстрого способа нахождения неизвестных прежде циклопептидов.

Так, статья группы Певзнера, недавно опубликованная в престижном журнале Cell Systems, описывает сразу более 400 новых циклопептидов. Для их выявления команде ученых потребовалось всего несколько дней работы их нового алгоритмического подхода, названного CycloNovo, на вычислительном кластере. За это время был обработан гигантский объем экспериментальных данных из образцов микробов и растений, полученных ранее другими учеными и выложенных в открытый доступ в надежде на появление соответствующих алгоритмов обработки.

CycloNovo анализирует выходные данные современных высокоточных масс-спектрометров — крайне чувствительных «молекулярных весов», которые разбивают молекулы на небольшие фрагменты и измеряют их массу. Путем анализа масс молекулярных фрагментов CycloNovo определяет, какие именно масс-спектры соответствуют циклопептидам, а не стандартным линейным соединениям, и затем выявляет их структуру — аминокислотную последовательность.

Всю эту процедуру можно сравнить с поиском иголки в стоге сена. И несмотря на то, что подобная вычислительная задача встала перед наукой уже более десяти лет назад, полноценно решить ее удалось только сейчас.

Любопытно, что предложенный алгоритм напоминает подход, используемый для решения задачи сборки генома, — совершенно другой области биоинформатики, в которую Центр алгоритмической биотехнологии также внес весомый вклад.

Первые же применения CycloNovo к реальным данным продемонстрировали его прикладную значимость как инструмента в руках ученых-биологов и уже успели привести к интересным с медицинской точки зрения результатам. Так, при помощи программы были проанализированы масс-спектры полученных образцов человеческого стула, которые профессор Ларри Смарр, один из соавторов статьи, собирал в течение четырех лет. В них было неожиданно обнаружено большое количество циклопептидов, свойственных семенам льна, а вовсе не бактериям, входящим в микробиоту человека.

Этот факт, на первый взгляд, ставит под вопрос корректность работы алгоритма и всего исследования в целом. Однако вскоре выяснилось, что Смарр употреблял льняное масло в рамках своей диеты, а дни употребления точно совпадают с датами, в которые собирались соответствующие образцы. Таким образом, впервые было наглядно продемонстрировано, что циклопептиды из пищи могут сохранять свою структуру при прохождении через неблагоприятную среду человеческого желудка и кишечника.

Вполне вероятно, что именно циклопептиды — основной фактор, объясняющий антимикробную активность семян льна. Другим немаловажным результатом данного эксперимента стало то, что циклопептиды семян льна — это всего лишь несколько представителей из сразу 79 циклопептидов, обнаруженных CycloNovo в исследуемых образцах стула.

Определение их биологической значимости и функций представляет собой отдельную задачу, над которой уже ведется работа в содружестве с медиками и биологами. Планируется, что к существующему анализу будут добавлены различные подходы к обработке дополнительных видов данных, полученных из человеческого микробиома.

Помимо Павла Певзнера в работе участвовали молодые ученые СПбГУ Андрей Пржибельский и Алексей Гуревич.

— Точный и быстрый алгоритм — это залог успеха биоинформатического инструмента. Однако это не единственная его составляющая. Крайне важно, чтобы созданной программой было легко пользоваться.

Только в этом случае она будет востребована научным сообществом и принесет реальную пользу. Как и в наших прошлых проектах по созданию инструментария для поиска антибиотиков и других биологически активных веществ, мы сделали CycloNovo максимально удобным даже для ученых с минимальным уровнем компьютерной грамотности.

Программу можно запустить буквально в пару кликов мышки, а результаты работы посмотреть прямо в вашем интернет-браузере, и ничего дополнительно устанавливать на свой компьютер не придется, — отмечает Андрей Гуревич, кандидат физико-математических наук и руководитель направления Natural Products Discovery в Центре алгоритмической биотехнологии.

Вместе с Певзнером, Гуревичем и Пржибельским в работе над CycloNovo принимали участие Бахар Бехсаз (аспирант UCSD), сотрудники UCSD Фернандо Варгас и профессор Ларри Смарр, профессор Хосейн Мохимани из Университета Карнеги-Меллона (США), а также доктор Джошуа Милн и его аспирант Марк Фишер из Университета Западной Австралии.

Проект был финансово поддержан грантами Российского научного фонда, UCSD, национальных институтов здравоохранения США, Австралийского совета по исследованиям и Правительства Австралии.

Пресс-служба СПбГУ
Ссылка по теме: doi.org/10.1016/j.cels.2019.11.007
18.12.2019, 252 просмотра.бактерии 


Частичная или полная перепечатка допускается только с указанием гиперссылки http://mednovelty.ru (в Интернете) или текстовой ссылки (в печати).

ИзображениеНаименование Цена 
Yory Трусики для менструации, непротекаемые, гигиенические, ночные. Размер LL (97-105)1075.00 
Yory Трусики для менструации, непротекаемые, гигиенические, дневные. Размер M (85-87)972.00 

Правовая оговорка: редакция MedNovelty.ru не намеревается давать читателям советы или рекомендации медицинского характера. Помните, пожалуйста, что лишь врач может составить профессиональное мнение и дать квалифицированный совет по лечению вашей болезни. Содержание редакционных материалов чаще всего основано на исследованиях, результаты или конечные продукты которых могут быть не одобрены регулирующими органами ввиду незавершенности. Сайт может содержать материалы 12+, 16+, 18+

Анонсы рубрики

Испытание препаратов безопаснее проводить на цифровой почкеИспытание препаратов безопаснее проводить на цифровой почке

Исследователи из университета Ватерлоо возглавили разработку первой компьютерной модели человеческой почки.

11 марта 2019г.
Аптечные маркетплейсы облегчат покупки лекарств в РоссииАптечные маркетплейсы облегчат покупки лекарств в России

Делать покупки в аптеке стало удобнее с помощью агрегатора «Ютека», разработанного российскими специалистами.

14 ноября 2018г.
Остановите антибиотики, пока не стало слишком поздно!

Пациентов, принимающих антибиотики всякий раз, когда у них потекло из носа, надлежит остановить, пока они не миновали точку невозврата — точку, после которой микроорганизмы станут невосприимчивыми к эффекту препаратов.

10 июля 2018г.
Рано или поздно нас всех заменят роботы

Вот, к примеру, недавно искусственный интеллект научился предсказывать побочные эффекты лекарственных комбинаций.

10 июля 2018г.
Создана электронная база веществ, продлевающих жизнь

Ученые английского университета Ливерпуля, работающие по эгидой Биогеронтологической исследовательской ассоциации (BGRF) впервые в мире собрали в единую базу все сведения, касающиеся способностей различных веществ влиять на продолжительность жизни живого организма.

14 июня 2017г.
Новые тадалафиловые БАД поступают к оптовикам и в аптеки

В интернете и даже в аптечных организациях на территории страны не составляет труда приобрести БАД, содержащие незаявленную при регистрации фармацевтическую субстанцию тадалафил.

12 декабря 2016г.
Фармрынок в Крыму растёт быстрее общероссийского

За восемь месяцев 2016 года через аптечную сеть Республики Крым было реализовано 20,9 млн. упаковок лекарств на сумму 2 999 млн. руб. в ценах закупки аптек. Доля Крыма в аптечном рынке России пока невелика и составляет 0,8% и в деньгах, и в упаковках.

06 октября 2016г.
На что способны антибиотики?

На международном конгрессе, организованном «Европейским респираторным обществом» в Лондоне, были представлены результаты новых медицинских исследований. Согласно выводам, сделанным в итоге этих исследований, воздействие антибиотиков на организм в раннем возрасте позднее приводит к повышенному риску возникновения аллергии.

12 сентября 2016г.
Ученые УрФУ разрабатывают лекарство для лечения лихорадки Западного Нила

Запатентованная химическая формула стала одним из ста лучших изобретений России. К разработке препарата для лечения лихорадки Западного Нила подключились специалисты Уральского федерального университета и Уральского центра биофармацевтических технологий.

26 августа 2016г.
Церебролизин активно используется в лечении СДВГ и приносит положительные результаты

Синдром дефицита внимания и гиперактивности (СДВГ) является одним из тех коварных расстройств когнитивной сферы, которые мешают нормальному развитию и при этом иногда весьма сложны в диагностике.

01 августа 2016г.
ФАС запретила рекламу «Сиалекс» и «Аликапс» на территории России

Федеральная антимонопольная служба (ФАС) России запретила рекламу БАДов «Сиалекс форте» и „Аликапс“ после запрета их продажи, сообщается в пресс-релизе ведомства.

06 июня 2016г.
Компания «ОТИСИФАРМ» получила престижную награду премии «Компания года 2015»

26 апреля 2016 состоялось награждение лауреатов престижной национальной премии «Компания года 2015», призванной отметить лучшие компании, персоналии и общественные события в России.

11 мая 2016г.
Более половины западных лекарственных средств проходят клинические испытания в России

С начала 2000-х годов европейские страны и США стали активно использовать научно-исследовательскую базу России, чтобы проводить испытания своих лекарственных средств.

05 мая 2016г.
Гриб Агарик Бразильский - от целого спектра заболеваний

Полезные свойства многих грибов были известны еще в древние времена. В наши дни ученые доказали, что эти растительные продукты способны противостоять такому серьезному заболеванию, как рак.

21 декабря 2015г.
Препаратом года объявлен Кагоцел

Кагоцел® стал победителем Международной фармацевтической премии «Зеленый крест» в категории „Препарат года“, номинация „Безрецептурный препарат“.

12 октября 2015г.
Сферическая обработка удвоила эффективность препарата от рака

Исследователи поместили популярный противораковый препарат в наночастицы, более чем удвоив его эффективность против опухолей.

04 августа 2015г.
Стартовали клинические исследования двух новых пятивалентных вакцин российского производства

С 1 июля 2015 года НПО «Микроген» начал клинические исследования новых комбинированных пятивалентных вакцин аАКДС-ГепВ+Хиб и АКДС-ГепВ+Хиб для профилактики коклюша, дифтерии, столбняка, гепатита В и инфекций, вызываемых Haemophilus influenzae тип b у детей.

02 июля 2015г.
Число сообщений о нежелательных реакциях на лекарственные средства в России выросло на 25%

Федеральная служба по надзору в сфере здравоохранения (Росздравнадзор) в июне 2015 года опубликовала итоги государственного контроля по мониторингу безопасности лекарственных средств. Согласно представленным данным число сообщений о нежелательных реакциях в России увеличилось на 25%.

02 июля 2015г.
В мае 2015 года в Россию было ввезено готовых лекарств на сумму 28,4 млрд рублей

Аналитическая компания RNC Pharma представляет обновление БД Импорт ЛП в Россию по итогам мая 2015 г. Май 2015 г. продолжил тенденцию, которая наметилась в апреле – рынок начал ощущать период сезонного спада.

01 июля 2015г.
При поддержке Минпромторга в России будет создано производство уникальной вакцины

В рамках ПМЭФ-2015 в присутствии главы Министерства промышленности и торговли Дениса Мантурова состоялось подписание меморандума о локализации производства в России современной 5-компонентной вакцины.

19 июня 2015г.

12345 Ctrl →




Возможны противопоказания. Проконсультируйтесь со специалистом!


Поиск на сайте

Ультразвуковое исследование имеет неоспоримые преимущества по сравнению с МРТ и КТ
Ультразвуковое исследование имеет неоспоримые преимущества по сравнению с МРТ и КТ

Технология УЗИ в последние годы существенно прогрессировала. Группа акушеров и гинекологов утверждает, что ультразвук рентабельней и безопасней других методов визуализации для обследования женского таза и должен быть первоочередным методом, применяемым к пациентам с тазовыми симптомами.

Вред микронаушников магнитов. Магнитные микронаушники опасны для здоровья и слуха!
Вред микронаушников магнитов. Магнитные микронаушники опасны для здоровья и слуха!

Последнее время в городских поликлиниках фиксируется увеличение количества обращений к врачам-отоларингологам с жалобами на ухудшение слуха и боли в ушах. Как ни странно, за врачебной помощью к ЛОР-врачам обращаются в основном молодые люди, в возрасте от 16 до 22-25 лет. Как выяснилось, проблема со слухом у людей данной возрастной категории возникает в основном у учащихся, студентов дневных и вечерних отделений.

Синдром Котара

Это редкое состояние, при котором пациент верит, что полностью или частично мертв или не существует.

Системная красная волчанка

Волчанка — хроническое заболевание, которое вызывает воспаление суставов, кожи и других органов.