Ученые из клиники Мэйо и Иллинойсского университета разработали новый одномолекулярный анализ для обнаружения метилированной ДНК. Метиляция — добавка молекул метиловой группы к ДНК — это один из методов регуляции генной экспрессии.
Результаты опубликованы в издании Scientific Reports.
«Хотя ранее нанопоры уже были исследованы на предмет геномного секвенирования и анализа, новое испытание может потенциально обойти потребность в некоторых текущих процессах в оценке эпигенетически связанных заболеваний», сообщил соисследователь Джордж Васмацис. по его словам, новый метод может избавить от необходимости бисульфитного преобразования ДНК, флуоресцентной разметки и цепной реакции полимеразы.
„Следующие шаги включают увеличение пространственного разрешения за счет внедрения более тонких мембран и аналогичных подготовительных шагов“, сказал профессор биоинжиниринга Рашид Башир.
Нанопора в данном случае — это очень маленькое отверстие в искусственной мембране, которое позволяет размещать и идентифицировать только одну молекулу. По словам ученых, этот метод весьма полезен, поскольку метиляция может указать на развитие опухоли большинства видов рака и может оказаться лучше, чем многие генетические маркеры. Теперь ученые могут отличать метилированную от неметилированной ДНК, прикрепляя белок на метилированные нуклеотиды и измеряя ионный электрический ток с помощью твердотельной нанопоры.
...
