Новые результаты показали удивительно сложную способность кодирования белка у человеческого цитомегаловируса или HCMV, и обеспечивают первые шаги к пониманию того, как вирус управляет клетками человека во время инфекции.
Впервые геном HCMV был секвенирован более 20 лет назад, однако теперь ученые исследовали протеому — весь набор выраженных белков — этого распространенного патогена.
Цитомегаловирус человека — невероятно успешный вирус, заражающий большинство людей на планете. Врожденные дефекты и болезнь, как известно, наблюдаются только у новорожденных младенцев и взрослых с ослабленным иммунитетом соответственно. Однако болезнетворный микроорганизм имеет также один из наибольших вирусных геномов, с массивом из 240000 базовых пар ДНК. Для сравнения, геном полиовируса содержит всего 7500 базовых пар.
Ноам Штерн-Гиносса из Калифорнийского университета в Сан-Франциско совместно с коллегами из США и Германии использовал комбинацию методов, включая профилирование рибосомы и масс-спектрометрию, для исследования протеомы цитомегаловируса человека. Метод может также использоваться для исследования белков, произведенных другими вирусами.
Результаты исследования опубликованы в издании Science.
«Геном вируса — это только отправная точка», пояснил Джонатан Вайссман из Калифорнийского университета, соавтор отчета. „Понимание того, какие именно белки кодируются этим геномом, позволит нам исследовать поведение вируса и то, как мы можем столкнуться с ним. Каждый из определенных нами белков способен сказать, как вирус манипулирует своей гостевой клеткой“.
Для подтверждения наличия множества неизвестных вирусных белков, которые были предсказаны разметкой позиций рибосомы, ученые применили масс-спектрометрию.
„Ключевое открытие нашей работы состоит в том, что каждый из этих шаблонов способен кодировать более одного белка“, сказала Аннет Михальски из института биохимии Макса Планка (Германия), еще один соавтор отчета. „И эти чрезмерно короткие белки могут быть распространены лучше, чем мы ожидаем“.
...
