В биоинформатике превращение большого объема геномных данных в значимую информацию является важной задачей, с основными значениями для человеческой биологии и медицины.
Ученые из медицинской школы Калифорнийского университета в Сан-Диего с коллегами предложили новый метод создания компьютерной модели клетки из массивных сетей генных и белковых взаимодействий, показывая, как гены и белки соединяются для формирования более высокоуровневых форм клеточных машин.
Результаты исследования опубликованы в издании Nature Biotechnology.
«Наш метод формирует онтологию или спецификацию всех главных игроков в клетке и отношений между ними», сказал первый автор Януш Датковски, постдокторант. Метод использует данные о том, как гены и белки взаимодействуют друг с другом, и автоматически организует эту информацию для формирования всестороннего каталога генных функций, клеточных компонентов и процессов.
„В нашей онтологии новое то, что создана она автоматически из массивов данных. Так, мы видим не только то, что уже известно, но и потенциально новые биологические компоненты и процессы — основы для новых гипотез“, сказал Датковски.
...
