Новый алгоритм изменяет то, как ученые строят сети из данных для того, чтобы помочь прогнозировать взаимодействия генов и препаратов.
Исследователи из медицинской школы Маунт Синай разработали новый вычислительный метод, который поможет ученым идентифицировать и расставить по приоритету гены, лекарственные цели и стратегии для репозиционирования препаратов, которые уже есть на рынке.
Добывая значительные объемы данных с большей простотой и эффективностью, ученые смогут лучше понять взаимодействия гена с геном, белка с белком и препарата с побочным эффектом. Новый алгоритм также поможет ученым определить последователей, с которыми они смогут продуктивно работать по теме.
Группа ученых во главе с доцентом фармакологии Ави Мааян и постдокторантом Нейлом Кларком использовали новый алгоритм для создания 15 различных типов генных сетей. Они также обнаружили новые связи между препаратами и побочными эффектами, и построили сеть сотрудничества, которая объединила ученых Маунт Синай, основываясь на их публикациях.
«Алгоритм упрощает построение сетей на основе данных», сказал доктор Мааян. „Как только данные будут преобразованы в сети, мы сможем понять их лучше и выявить новые существенные связи, а также сосредоточиться на важных особенностях этих данных“. Результаты опубликованы в изданиях BMC Bioinformatics и BMC Systems Biology.
...
