Ученые из университета Сент-Луиса описали технологию, которая способна выявлять новые, ранее неизвестные вирусы.
Технология обладает потенциалом для обследования пациента на вирусы, даже когда медики не определили специфический вирус как наиболее вероятный источник инфекции.
В новом подходе ученые использовали сыворотку крови как биологический источник, чтобы категоризировать и обнаруживать вирусы.
Используя полную расшифровку человеческого генома, исследователи применили подход секвенирования следующего поколения под названием субтракция транскриптома. С помощью этого метода ученые субтрагировали человеческий геном целиком из генетического материала в исследуемой крови. Исследуя то, что осталось в результате, ученые сумели идентифицировать в крови вирусный генетический материал.
«Мы открыли технологию, которая позволяет нам выявлять новые вирусы», сказал исследователь Эдриан Ди Биссегли. „Мы изолировали ДНК и РНК, умножили количество генетического материала в крови, провели ультраглубокое секвенирование и применили алгоритм для поиска совпадений каждого известного фрагмента генетического кода, как человеческого, так и микробного. После удаления неизвестных частей мы получаем новые вирусы“.
Результаты опубликованы в издании Biochemical and Biophysical Research Communications.
