Исследователи из высшей медицинской школы при Бостонском университете (BUSM) провели первую масштабную оценку генома с целью поиска генетических вариантов, связанных с болезнью Паркинсона (БП). В исследовании, которое опубликовано в Интернете в «PLoS ONE», отмечена связь определенных генов и изменение их экспрессии с влиянием на вероятность развития БП.
Жанн Латурелль, доктор технических наук, доцент кафедры неврологии в BUSM, выступает в качестве ведущего автора исследования, а Ричард Х. Майерс, кандидат наук, профессор неврологии в BUSM, выступает в качестве главного исследователя изучения и старшего автора.
Недавняя статья, опубликованная консорциумом масштабного исследования генома с целью поиска ассоциации с БП (PDGC) подтвердила, что повышенный риск БП был замечен у людей с генетическими вариантами, находящимися внутри или поблизости от генов SNCA, MAPT, GAK/DGKQ, HLA и RIT2, но механизм этого повышенного риска не был определен.
„Одним из возможных результатов этой вариативности, вероятно, является изменение того, каким образом ген экспрессируется в головном мозге, что и приводит к увеличению риска развития БП“, — говорит Латурелль.
Чтобы исследовать теорию, исследователи изучили взаимосвязь между связанными с БП генетическими вариантами и уровнями экспрессии генов в образцах мозга из лобной коры 26 образцов с подтвержденной БП и 24 неврологически здоровых контрольных образцов. Экспрессия генов была определена с помощью микросборок, которые анализировали влияние генетических вариантов на экспрессию генов, расположенных в непосредственной близости от варианта, так называемые цис-эффекты, и гены, которые находятся далеко от варианта, например, такие, как гены в совершенно другой хромосоме, называемые транс- эффекты.
Анализ цис-эффектов показал, что несколько генетических вариантов на участке MAPT проявили достаточную степень ассоциации с экспрессией нескольких близлежащих генов, включая ген LOC644246, дублированные гены LRRC37A и LRRC37A2 и ген DCAKD. Значительные цис-эффекты наблюдались также между вариантами на участке HLA на хромосоме 6 и двух близлежащих генах HLA-DQA1 и HLA-DQA1. Исследование транс-эффектов выявило 23 изменения последовательности ДНК, которые достигли статистической значимости, в том числе и с вариантами генов SNCA, MAPT и RIT2.
„Определение конкретных измененных генов при БП открывает возможности для дальнейшего их изучения на подопытных лабораторных живых организмах или группах клеток с целью выявления препаратов, которые могут устранить дефекты и выступить в качестве средства для лечения БП“, — сказал Майерс.
...
